Directorio
La toma de decisiones en Transener está a cargo del Directorio, compuesto por nueve directores titulares y nueve directores suplentes.
Comisión Fiscalizadora
La fiscalización de Transener está a cargo de una Comisión Fiscalizadora integrada por tres síndicos titulares y tres síndicos suplentes.
Comité de Auditoría
El Comité de Auditoría de Transener está integrado por dos directores independientes y un director no independiente, todo ello de acuerdo a los criterios que establece la Comisión Nacional de Valores.